Université de Lyon 1 - Ingénieur d'Étude Base de Données H/F - 38

Les activités du LBBE s'appuient sur trois piliers : les développements méthodologiques en statistique, informatique et mathématique pour la modélisation du vivant, l'écologie et l'évolution, de l'échelle moléculaire à celle des communautés, et enfin la santé humaine et animale. Ces piliers sont au coeur des enjeux scientifiques et sociétaux liés à la gestion de données hétérogènes dans un contexte de crise de la biodiversité et d'approche intégrée de la santé. Le laboratoire, qui regroupe 220 membres, est organisé en quatre départements scientifiques et trois pôles administratifs et techniques. La personne recrutée rejoindra le Pôle Informatique, composé de 9 personnels permanents, sur le campus LyonTech-la Doua. Le Pôle Informatique travaille en forte interaction avec les équipes de recherche du département Écologie Évolutive, et est partie prenante de la réflexion stratégique du laboratoire. Ses activités couvrent : la gestion d'infrastructures de calcul et de stockage (cluster de 1 200 coeurs / 1 Pb de données ; cloud de 224 vCPU / 400 To), le développement de logiciels et de services, et enfin l'analyse de données. Le LBBE porte une attention particulière au bien-être et à la qualité de vie au travail de ses personnels, et s'inscrit dans une démarche active en faveur de l'inclusion, de la diversité et de l'égalité professionnelle.

Contexte

Le Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE) porte plusieurs suivis à long terme (>10 ans) de populations animales et végétales permettant d'aborder des questions centrales en écologie évolutive. Ces suivis ont récemment obtenu le label SEE-Life du CNRS Écologie et Environnement, visant à assurer leur pérennité scientifique.

Parmi eux :

- Le suivi d'une population de sangliers de la forêt de Châteauvillain-Arc-en-Barrois, débuté en 1981, qui a permis l'acquisition de données longitudinales sur plusieurs milliers d'individus.
- Un programme sur les stratégies de reproduction des arbres de forêts tempérées (masting) et la régénération forestière dans le contexte du changement climatique. Depuis 2012, ce suivi porte sur la floraison et la fructification de 150 chênes sessiles, étendu depuis 2024 à 560 arbres incluant chênes et hêtres.

Ces programmes contribuent à l'avancée des connaissances fondamentales et à leur transfert pour la gestion durable de la biodiversité. Les données collectées doivent être bancarisées dans des bases structurées, documentées, sécurisées et pérennes, conformément aux principes FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables et Réutilisables).

Mission principale

Vous intégrerez le Pôle Informatique du LBBE et travaillerez en lien étroit avec les chercheurs et chercheuses impliqués dans les suivis « sangliers » et « chênes », les personnels de terrain et les partenaires institutionnels (notamment l'Office Français de la Biodiversité et l'Office National des Forêts).

Vous contribuerez à la conception, au développement, à la structuration et à la mise en oeuvre de bases de données relationnelles destinées à bancariser les données issues de ces suivis de terrain.

Vous pourrez intervenir à différentes étapes du cycle de vie des bases de données : modélisation, intégration des données existantes, développement d'interfaces de saisie ou de consultation, documentation des outils et accompagnement des utilisateurs.

Vous veillerez à respecter les standards en vigueur et à intégrer votre travail dans les catalogues et référentiels mis en place par les tutelles (NUM-DATA, InDoRES).

Activités principales

- Créer ou faire évoluer un modèle relationnel pertinent pour la structuration des données.
- Recueillir, analyser et formaliser les données existantes (fichiers Excel, carnets de terrain, bases locales) et les procédures associées.
- Mettre en oeuvre des scripts d'import de données, en assurant leur validation et leur nettoyage.
- Développer ou adapter des interfaces web de saisie et de consultation.
- Documenter les bases de données, modèles, processus et outils.
- Accompagner les utilisateurs et utilisatrices dans l'usage quotidien des bases.